自1998年财政部与卫生部印发《医院会计制度》以来，时隔十三年，医院财务、会计制度终于将在“十二五”的开局元年迎来一系列的重大创新与重要调整。根据国务院医改工作统一部署，财政部会同卫生部等有关部门于2011年1月18日同步推出了修订后的《医院财务制度》和《医院会计制度》、新制定的《基层医疗卫生机构财务制度》和《基层医疗卫生机构会计制度》以及中国会计师协会制定印发的《医院财务报表审计指引》这五项制度。其中新的医院财务、会计制度将于2011年7月1日起在公立医院改革国家联系试点城市执行，2012年1月1日起在全国执行，基层医疗卫生机构财务、会计制度和医院财务报表审计指引也将自2011年7月1日起全面实行。

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2011年4月，金蝶友商网隆重推出友商KIS行政事业版V9.0，全面支持新《医院会计制度》、《基层医疗卫生机构会计制度》。按照新会计制度的要求，预置了所有的会计科目、现金流量项目、资产类型、会计报表、财务分析指标表等基础编码和账表，极大方便了用户在新制度下新建账套的初始化工作。

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